То, что потом линукс неживой и ничего не работает - это понятно. А вот почему практически мгновенно выбрасывает из шелла - это мне непонятно. Ведь вроде все необходимые программы запущены, всё подгружено. Даже если поудалять все файлы - все равно указатели-то на них живут ...
P.S.Кстати, проапгрейдиться с чистого FC2 до up-to-date FC3 - в плане трафика гораздо дешевле, чем с up-to-date FC2 до up-to-date FC3. В первом случаем тащится 457 пакетов, а во втором - 628.